Заходим через SSH по логину и паролю
Вводим
sudo -s
Заходим в конфиг
cd /etc/apt/apt.conf.d
После создаем
nano 10proxy
В нем пишем

Код:
Acquire::http::Proxy "http://username:password@ип:порт"; - если есть авторизация

Acquire::http::Proxy "http://ип:порт";

Сохраняем и проверяем нэт командой sudo apt-get update